Estrategia de tamizaje para la selección de epítopes de Leishmania spp en humanos por medio del análisis de interacciones moleculares: un acercamiento desde la bioinformática

Resumen

Introducción. El parásito Leishmania es fagocitado por los macrófagos y se aloja en el fagolisosoma; por consiguiente, se necesita la activación por los linfocitos CD4-Th1 para controlar la infección. La presentación antigénica es crítica para dicha activación al presentar secuencias cortas del parásito en el bolsillo de las moléculas del complejo mayor de histocompatibilidad (CMH) de clase II. Objetivo. Identificar las secuencias lineales de proteínas inmunogénicas de Leishmania (Viannia) spp., mediante herramientas bioinformáticas frente a moléculas humanas del CMH de clase II. Materiales y métodos. Se tomaron secuencias lineales de las proteínas GP63, HSP70 y PEPCK de Leishmania panamensis y se predijo la unión de secuencias de 15 aminoácidos frente a diversos HLA-DRβ*04 por medio de herramientas de predicción. Se confirmó que las regiones están muy conservadas entre las especies del parásito, con nula o poca analogía con las proteínas humanas. Finalmente, se analizaron las interacciones de los péptidos con mejores resultados por acoplamiento molecular frente al HLA-DRβ*04:01. Resultados. En la primera fase del estudio, se identificaron seis secuencias con gran potencial de ser epítopos T naturales de Leishmania spp. Las secuencias GP63267-282, GP63282-297 y PEPCK535-550 presentaron múltiples interacciones y bajas energías de interacción frente al bolsillo del HLA-DRβ*04:01 y orientación de N-terminal a C-terminal. Conclusiones. Se identificaron tres secuencias como posibles epítopos Th1 de Leishmania spp.; sin embargo, es necesaria la validación in vitro para confirmar estos hallazgos.